La struttura organizzativa di Hera Comm Marche è molto snella, tipica di un’azienda a vocazione commerciale. La maggior parte dei servizi amministrativi, tecnici e logistici vengono ricevuti in service dalla società Marche Multiservizi Spa, essa stessa parte integrante del GRUPPO HERA.  Hera Comm Marche svolge invece in proprio una parte delle attività di gestione della clientela e tutta l’attività commerciale sul libero mercato.

La creazione di sinergie (per ridurre i costi) e la visione unitaria del Cliente sono tra i punti fermi dell’organizzazione di Hera Comm Marche. Per questo molti degli gli sportelli clienti dell’azienda sono integrati con quelli dalla società Marche Multiservizi Spa (Sportelli mms), azienda che già fornisce i servizi acqua, fognature, e igiene ambientale nel territorio della provincia di Pesaro e Urbino

L'azienda è organizzata per segmenti di clientela:         

• Agenzie esterne         
• Account dedicati
• Sportelli clienti e Sportelli Mms sul territorio
• Call center 800 991 111
• Gestione Clienti
• Staff di coordinamento per attività logistiche e amministrative.

L’azienda è guidata da un Consiglio di Amministrazione il cui Presidente è Michele Sadori e il cui Amministratore Delegato è Cristian Fabbri.